Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED4Q9NPJ6 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.1 ms