Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FANCFQ9NPI8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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