Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms