Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms