Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN18Q96SJ8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms