Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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TRIM11Q96F44 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TRIM11Q96F44 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRIM11Q96F44 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRIM11Q96F44 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRIM11Q96F44 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRIM11Q96F44 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRIM11Q96F44 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRIM11Q96F44 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TRIM11Q96F44 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM11Q96F44 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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