Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms