Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL3Q8IVW4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms