Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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