Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms