Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms