Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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