Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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