Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms