Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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GRIK4Q16099 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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GRIK4Q16099 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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GRIK4Q16099 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms