Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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