Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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