Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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COL4A6Q14031 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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