Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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