Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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PTPN13Q12923 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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PTPN13Q12923 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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PTPN13Q12923 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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PTPN13Q12923 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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