Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms