Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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EFEMP1Q12805 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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EFEMP1Q12805 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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EFEMP1Q12805 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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EFEMP1Q12805 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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EFEMP1Q12805 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFEMP1Q12805 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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