Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FMODQ06828 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
FMODQ06828 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 4123.2 ms