Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms