Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA4P51532 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms