Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms