Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBL1P28749 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBL1P28749 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBL1P28749 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBL1P28749 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBL1P28749 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBL1P28749 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBL1P28749 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBL1P28749 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBL1P28749 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBL1P28749 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBL1P28749 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBL1P28749 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBL1P28749 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBL1P28749 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBL1P28749 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBL1P28749 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBL1P28749 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms