Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDSP20132 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDSP20132 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDSP20132 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDSP20132 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDSP20132 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDSP20132 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDSP20132 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDSP20132 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms