Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms