Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms