Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms