Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms