Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms