Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FANCFQ9NPI8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FANCFQ9NPI8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FANCFQ9NPI8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FANCFQ9NPI8 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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