Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms