Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00208Q96KT6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms