Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms