Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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