Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms