Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAPD7Q5XG87 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms