Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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SP6Q3SY56 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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SP6Q3SY56 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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