Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SGCBQ16585 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SGCBQ16585 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SGCBQ16585 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SGCBQ16585 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SGCBQ16585 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SGCBQ16585 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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