Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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DDB1Q16531 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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DDB1Q16531 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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DDB1Q16531 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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DDB1Q16531 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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DDB1Q16531 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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DDB1Q16531 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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DDB1Q16531 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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DDB1Q16531 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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