Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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GABRA6Q16445 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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