Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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