Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC85BQ15834 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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