Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms