Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMC2Q13753 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms