Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms