Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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FOXE3Q13461 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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FOXE3Q13461 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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FOXE3Q13461 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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FOXE3Q13461 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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FOXE3Q13461 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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FOXE3Q13461 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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